Packagetaxlistversion 0.2.4
Description
将 taxlist 对象打印分类层次结构(等级和父子关系)输出为缩进列表。
Usage
indented_list(object, ...)## S4 method for signature 'taxlist'indented_list(object,filter,keep_children = TRUE,keep_parents = TRUE,rankless_as,indent = " ",lead_br = "",print = TRUE,author = TRUE,level = FALSE,synonyms = FALSE,syn_encl = c("= ", ""),secundum,alphabetical = FALSE,...)
Arguments
参数【object】:包含分类概念(taxonomic concepts)的一个 taxlist 对象。
参数【…】:其余参数(尚未可用)。
参数【filter】:一个字符值(可选),该值将与分类单元用法名称匹配,以生成“object”的子集。请注意,此过滤器也将应用于 synonyms,与参数“synonyms”中应用的参数无关。
参数【keep_children】:一个逻辑值,指示结果中是否应包含匹配概念的子项。
参数【keep_parents】:一个逻辑值,指示结果中是否应包含匹配概念的父级。
参数【rankless_as】:一个字符向量,指示在执行列表之前可以将无等级分类群设置为的级别(分类等级)。
参数【indent】:用于缩进的符号。该符号将乘以分类等级的深度。默认值为空格。这也可以作为命名向量提供,并为相应的分类等级提供不同的缩进符号。
参数【lead_br】:可选换行符号在缩进前行。r-markdown 文档可能需要它。
参数【print】:一个逻辑值,指示是否应在控制台中打印缩进列表 (default = TRUE)。
参数【author】:一个逻辑值,指示是否应使用姓名打印作者 (default = TRUE)。
参数【level】:一个逻辑值,指示是否应在名称之前包含级别名称(分类等级)(默认值 = FALSE)。
参数【synonyms】:一个逻辑值,指示是否应将同义词包含在接受的名称之后 (default = FALSE)。
参数【syn_encl】:长度为 2 的字符向量,包括用于括同义词的符号。第一个值将设置在同义词之前,第二个值将设置在同义词之后。
参数【secundum】:与插槽“taxonViews”中的名称匹配的字符值,该名称将打印为 secundum(分类视图)。默认情况下不打印它。
参数【alphabetical】:一个逻辑值,指示分类群是按名称还是按 ID 排序。默认值为 FALSE,因此分类群按 ID 排序。请注意,如果对象包含同名分类群,则参数 TRUE 可能无法正常工作。
Value
如果“print = TRUE”,则在控制台中打印缩进列表。结果是一个数据框,其中包含用于设置名称格式的元素,也可以分配给对象。
Examples
直接输出缩进列表:
indented_list(Easplist, "papyrus")
Cyperaceae Juss. Cyperus L. Cyperus papyrus L.
indented_list(Easplist, "papyrus", level = TRUE, synonyms = TRUE,secundum = "secundum")
family Cyperaceae Juss. sec. The Plant List (2013) genus Cyperus L. sec. Taxonomic Name Resolution Service (2018) species Cyperus papyrus L. sec. African Plant Database (2012) = Cyperus papyrus ssp. antiquorum (Willd.) Chiov. = Cyperus papyrus ssp. nyassicus Chiov.