最近在着手于使用ConvLSTM进行时空序列预测问题,由于本人刚接触深度学习,很多代码都还理不清,故想到自己通过记录来加深对模型的理解,肯定会有很多问题和不专业的地方,若有网友看见,请不吝指教,谢谢。
ConvLSTM是施博士在《Convolutional LSTM Network: A Machine Learning Approach for Precipitation Nowcasting》论文首次提出,ConvLSTM同时拥有LSTM的时间序列处理能力和CNN的空间特征处理能力,可用于处理如降雨天气预报等时空序列问题。
在此,不仔细讨论ConvLSTM的原理,但要知道一个基本的就是ConvLSTM是直接基于LSTM改出来的(我的理解),LSTM中每个时间点输入的是一维数据,而ConvLSTM就是LSTM每个时间点中输入二维数据,然后在这个时间点里卷积存入有价值的信息。
这张图片也摘至网络,想主要说明的一点就是ConvLSTM中的层数就指的是LSTM的层数,每个时间点前后有h和c的传入传出,每层之间的时间点之间有着h的传入和传出。
本人选择CDSN中最常见的,基于Pytorch深度学习框架的ConvLSTM代码,在他人已有注解的情况下,逐行进行代码更详细的注解,供像我这样的新手学习。
import numpy as npfrom torch.utils.data import Dataset,DataLoaderimport torchimport torch.nn as nn"""定义ConvLSTM每一层的、每个时间点的模型单元,及其计算。"""class ConvLSTMCell(nn.Module):def __init__(self, input_dim, hidden_dim, kernel_size, bias):"""单元输入参数如下:input_dim: 输入张量对应的通道数,对于彩图为3,灰图为1。hidden_dim: 隐藏状态的神经单元个数,也就是隐藏层的节点数,应该可以按计算需要“随意”设置。kernel_size: (int, int),卷积核,并且卷积核通常都需要为奇数。bias: bool,单元计算时,是否加偏置,通常都要加,也就是True。"""super(ConvLSTMCell, self).__init__() #self:实例化对象,__init__()定义时该函数就自动运行, #super()是实例self把ConvLSTMCell的父类nn.Modele的__init__()里的东西传到自己的__init__()里 #总之,这句是搭建神经网络结构必不可少的。 self.input_dim = input_dimself.hidden_dim = hidden_dimself.kernel_size = kernel_sizeself.padding = kernel_size[0] // 2, kernel_size[1] // 2 #//表示除法后取整数,为使池化后图片依然对称,故这样操作。self.bias = bias"""nn.Conv2D(in_channels,out_channels,kernel_size,stride,padding,dilation=1,groups=1,bias)二维的卷积神经网络"""self.conv = nn.Conv2d(in_channels=self.input_dim + self.hidden_dim, #每个单元的输入为上个单元的h和这个单元的x,#所以h和x要连接在一起,在x的通道数上与h的维度上相连。out_channels=4 * self.hidden_dim, #输入门,遗忘门,输出门,激活门是LSTM的体现,#每个门的维度和隐藏层维度一样,这样才便于进行+和*的操作#输出了四个门,连接在一起,后面会想办法把门的输出单独分开,只要想要的。kernel_size=self.kernel_size,padding=self.padding,bias=self.bias) def forward(self, input_tensor, cur_state): """input_tensor:此时还是四维张量,还未考虑len_seq,[batch_size,channels,h,w],[b,c,h,w]。cur_state:每个时间点单元内,包含两个状态张量:h和c。"""h_cur, c_cur = cur_state #h_cur的size为[batch_size,hidden_dim,height,width],c_cur的size相同,也就是h和c的size与input_tensor相同 combined = torch.cat([input_tensor, h_cur], dim=1)#把input_tensor与状态张量h,沿input_tensor通道维度(h的节点个数),串联。#combined:[batch_size,input_dim+hidden_dim,height,weight]combined_conv = self.conv(combined) #Conv2d的输入,[batch_size,channels,height,width]#Conv2d的输出,[batch_size,output_dim,height,width],这里output_dim=input_dim+hidden_dimcc_i, cc_f, cc_o, cc_g = torch.split(combined_conv, self.hidden_dim, dim=1) #将conv的输出combined_conv([batch_size,output_dim,height,width])#分成output_dim这个维度去分块,每个块包含hidden_dim个节点信息#四个块分别对于i,f,o,g四道门,每道门的size为[b,hidden_dim,h,w]i = torch.sigmoid(cc_i) # 输入门f = torch.sigmoid(cc_f) # 遗忘门o = torch.sigmoid(cc_o) # 输出门g = torch.tanh(cc_g) #激活门 c_next = f * c_cur + i * g #主线,遗忘门选择遗忘的+被激活一次的输入,更新长期记忆。h_next = o * torch.tanh(c_next) #短期记忆,通过主线的激活和输出门后,更新短期记忆(即每个单元的输出)。 return h_next, c_next #输出当前时间点输出给下一个单元的,两个状态张量。 def init_hidden(self, batch_size, image_size):"""初始状态张量的定义,也就是说定义还未开始时输入给单元的h和c。"""height, width = image_sizeinit_h = torch.zeros(batch_size, self.hidden_dim, height, width, device=self.conv.weight.device) #初始输入0张量init_c = torch.zeros(batch_size, self.hidden_dim, height, width, device=self.conv.weight.device) #[b,hidden_dim,h,w] #self.conv.weight.device表示创建tensor存放的设备 #和conv2d进行的设备相同 return (init_h,init_c)"""定义整个ConvLSTM按序列和按层数的结构和计算。输入介绍:五维数据,[batch_size,len_seq,channels,height,width] or [l,b,c,h,w]。输出介绍:输出两个列表:layer_output_list和last_state_list。列表0:layer_output_list--单层列表,每个元素表示一层LSTM层的输出h状态,每个元素的size=[b,l,hidden_dim,h,w]。列表1:last_state_list--双层列表,每个元素是一个二元列表[h,c],表示每一层的最后一个时间单元的输出状态[h,c], h.size=c.size=[b,hidden_dim,h,w]使用示例:>> x = torch.rand((64, 20, 1, 64, 64))>> convlstm = ConvLSTM(1, 30, (3,3), 1, True, True, False)>> _,last_states = convlstm(x)>> h = last_states[0][0]#第一个0表示要第1层的列表,第二个0表示要h的张量。"""class ConvLSTM(nn.Module): """输入参数如下:input_dim:输入张量对应的通道数,对于彩图为3,灰图为1。hidden_dim:h,c两个状态张量的节点数,当多层的时候,可以是一个列表,表示每一层中状态张量的节点数。kernel_size:卷积核的尺寸,默认所有层的卷积核尺寸都是一样的,也可以设定不同的lstm层的卷积核尺寸不同。num_layers:lstm的层数,需要与len(hidden_dim)相等。batch_first:dimension 0位置是否是batch,是则True。bias:是否加偏置,通常都要加,也就是True。return_all_layers:是否返回所有lstm层的h状态。"""def __init__(self, input_dim, hidden_dim, kernel_size, num_layers, batch_first=True, bias=True, return_all_layers=False):super(ConvLSTM, self).__init__()self._check_kernel_size_consistency(kernel_size) #后面def了的,检查卷积核是不是列表或元组。kernel_size = self._extend_for_multilayer(kernel_size, num_layers) # 如果为多层,将卷积核以列表的形式分入多层,每层卷积核相同。hidden_dim = self._extend_for_multilayer(hidden_dim, num_layers) # 如果为多层,将隐藏节点数以列表的形式分入多层,每层卷积核相同。if not len(kernel_size) == len(hidden_dim) == num_layers: # 判断卷积层数和LSTM层数的一致性,若不同,则报错。raise ValueError('Inconsistent list length.') self.input_dim = input_dimself.hidden_dim = hidden_dimself.kernel_size = kernel_sizeself.num_layers = num_layersself.batch_first = batch_firstself.bias = biasself.return_all_layers = return_all_layers #一般都为False。 cell_list = [] #每个ConvLSTMCell会存入该列表中。for i in range(0, self.num_layers): # 当LSTM为多层,每一层的单元输入。if i==0:cur_input_dim = self.input_dim #一层的时候,单元输入就为input_dim,多层的时候,单元第一层输入为input_dim。else:cur_input_dim = self.hidden_dim[i - 1] #多层的时候,单元输入为对应的,前一层的隐藏层节点情况。cell_list.append(ConvLSTMCell(input_dim=cur_input_dim,hidden_dim=self.hidden_dim[i],kernel_size=self.kernel_size[i],bias=self.bias))self.cell_list = nn.ModuleList(cell_list) # 把定义的多个LSTM层串联成网络模型,ModuleList中模型可以自动更新参数。 def forward(self, input_tensor, hidden_state=None):"""input_tensor: 5D张量,[l, b, c, h, w] 或者 [b, l, c, h, w]hidden_state: 第一次输入为None,Returns:last_state_list, layer_output"""if not self.batch_first:input_tensor = input_tensor.permute(1, 0, 2, 3, 4) # (t, b, c, h, w) -> (b, t, c, h, w) if hidden_state is not None:raise NotImplementedError()else:b, _, _, h, w = input_tensor.size()# 自动获取 b,h,w信息。hidden_state = self._init_hidden(batch_size=b,image_size=(h, w)) layer_output_list = []last_state_list = [] seq_len = input_tensor.size(1)#根据输入张量获取lstm的长度。cur_layer_input = input_tensor #主线记忆的第一次输入为input_tensor。 for layer_idx in range(self.num_layers):#逐层计算。 h, c = hidden_state[layer_idx] #获取每一层的短期和主线记忆。output_inner = []for t in range(seq_len):#序列里逐个计算,然后更新。h, c = self.cell_list[layer_idx](input_tensor=cur_layer_input[:, t, :, :, :],cur_state=[h, c])output_inner.append(h)#第layer_idx层的第t个stamp的输出状态。 layer_output = torch.stack(output_inner, dim=1)#将第layer_idx层的所有stamp的输出状态串联起来。cur_layer_input = layer_output #准备第layer_idx+1层的输入张量,其实就是上一层的所有stamp的输出状态。 layer_output_list.append(layer_output)#当前层(第layer_idx层)的所有timestamp的h状态的串联后,分层存入列表中。last_state_list.append([h, c])#当前层(第layer_idx层)的最后一个stamp的输出状态的[h,c],存入列表中。 if not self.return_all_layers: #当不返回所有层时layer_output_list = layer_output_list[-1:]#只取最后一层的所有timestamp的h状态。last_state_list = last_state_list[-1:] #只取最后一层的最后的stamp的输出状态[h,c]。 return layer_output_list, last_state_list def _init_hidden(self, batch_size, image_size):"""所有lstm层的第一个时间点单元的输入状态。"""init_states = []for i in range(self.num_layers):init_states.append(self.cell_list[i].init_hidden(batch_size, image_size)) #每层初始单元,输入h和c,存为1个列表。return init_states @staticmethod #静态方法,不需要访问任何实例和属性,纯粹地通过传入参数并返回数据的功能性方法。def _check_kernel_size_consistency(kernel_size):"""检测输入的kernel_size是否符合要求,要求kernel_size的格式是list或tuple"""if not (isinstance(kernel_size, tuple) or(isinstance(kernel_size, list) and all([isinstance(elem, tuple) for elem in kernel_size]))):raise ValueError('`kernel_size` must be tuple or list of tuples') @staticmethod def _extend_for_multilayer(param, num_layers):"""扩展到LSTM多层的情况"""if not isinstance(param, list):param = [param] * num_layersreturn paramx = torch.rand((64, 20, 1, 64, 64))convlstm = ConvLSTM(1, 30, (3,3), 1, True, True, False)_, last_states = convlstm(x)h = last_states[0][0]# 第一个0表示要第一层的列表,第二个0表示要列表里第一个位置的h输出。
设定ConvLSTM为1层,每层隐藏单元节点数为30,卷积核(3,3),这个程序运行后可以发现,输入x的size为[64,20,1,64,64],输出的第一层h的size为[64,30,64,64],符合预期。